微波干燥設備的微波只能被極性分子吸收，遇到金屬物體會像可見光遇到鏡子一樣被反射，且普通金屬在微波作用下產生表面渦流，并引起打火現象。因此，大多采用表面電阻較小的不銹鋼作為微波爐體。為避免意外打火引起設備損壞，在微波干燥設備使用操作規程中明確規定，開機前 清理爐體內的金屬物體。投入輸送帶的物料不能超出輸送帶承載能力，投入過多物料容易掉落在爐腔內，當水分蒸發完畢后，物料由于過熱而燃燒。當發生這種情況時，應立即關閉微波源，然后打開爐門用濕毛巾將火撲滅，并將剩余物清理。
微波是一種不可見的電磁波，大劑量的微波會對人體造成傷害。雖然微波干燥設備已采取多種屏蔽措施，但生產過程中爐門屏蔽網、出口微波 器，難免會有損壞，微波干燥設備爐體、爐門受熱后會發生變形，密封程度有所減弱，這些因素都會導致微波的泄漏。在生產班組配備小型微波泄漏檢測儀，是微波設備運行的重要保障。

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